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Cluster: HRGMv2_3185_CGC43

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_9 11356 12381 + GH130_5
TC HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_10 12434 13354 + 3.A.1.1.29
TC HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_11 13380 14276 + 3.A.1.1.29
TC HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_12 14327 16084 + 3.A.1.1.29
CAZyme HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_13 16165 17178 + GH10
TC HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_14 17175 18533 + 2.A.66.1.45
pfam HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_15 18553 19602 + UxuA
pfam HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_16 19612 20421 + adh_short | adh_short_C2
CAZyme HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_17 20459 21541 + CE17
CAZyme HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_18 21562 22719 + GH88
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_19 22749 24083 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_20 24123 25901 + 3.A.1.106.3
TC HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_21 25904 27667 + 3.A.1.106.3
TC HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_22 29146 30228 + 3.A.1.1.23
TC HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_23 30243 31142 + 3.A.1.1.4
TC HRGMv2_3185_17 HRGMv2_3185_17_24 31142 31978 + 3.A.1.1.20
Gene ID: HRGMv2_3185_17_9
Type: CAZyme
Location: 11356 - 12381 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_10
Type: TC
Location: 12434 - 13354 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_11
Type: TC
Location: 13380 - 14276 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_12
Type: TC
Location: 14327 - 16084 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_13
Type: CAZyme
Location: 16165 - 17178 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_14
Type: TC
Location: 17175 - 18533 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_15
Type: pfam
Location: 18553 - 19602 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_16
Type: pfam
Location: 19612 - 20421 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_17
Type: CAZyme
Location: 20459 - 21541 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_18
Type: CAZyme
Location: 21562 - 22719 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_19
Type:
Location: 22749 - 24083 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_20
Type: TC
Location: 24123 - 25901 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_21
Type: TC
Location: 25904 - 27667 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_22
Type: TC
Location: 29146 - 30228 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_23
Type: TC
Location: 30243 - 31142 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_17_24
Type: TC
Location: 31142 - 31978 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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