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Cluster: HRGMv2_4626_CGC10

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_36 53342 54493 + GT4
CAZyme HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_37 54490 55374 + GT2
pfam HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_38 55389 56603 - Acyl_transf_3
pfam HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_39 56600 58465 - Wzy_C | Kdo
TC HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_40 58623 60428 + 3.A.1.106.1
STP HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_41 60723 62087 + PfkB
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_42 62198 63154 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_43 63197 64009 - 8.A.5.1.4
pfam HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_44 64006 65181 - FAD_binding_2 | DAO | FAD_binding_3 | NAD_binding_8
TC HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_45 65369 65701 - 2.A.7.1.11
CAZyme HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_46 65847 67124 + GT30
pfam HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_47 67121 71809 - ToxA_N
TC HRGMv2_4626_11 HRGMv2_4626_11_48 71968 72597 - 2.A.6.2.27
Gene ID: HRGMv2_4626_11_36
Type: CAZyme
Location: 53342 - 54493 (+)
Gene ID: HRGMv2_4626_11_37
Type: CAZyme
Location: 54490 - 55374 (+)
Gene ID: HRGMv2_4626_11_38
Type: pfam
Location: 55389 - 56603 (-)
Gene ID: HRGMv2_4626_11_39
Type: pfam
Location: 56600 - 58465 (-)
Gene ID: HRGMv2_4626_11_40
Type: TC
Location: 58623 - 60428 (+)
Gene ID: HRGMv2_4626_11_41
Type: STP
Location: 60723 - 62087 (+)
Gene ID: HRGMv2_4626_11_42
Type:
Location: 62198 - 63154 (-)
Gene ID: HRGMv2_4626_11_43
Type: TC
Location: 63197 - 64009 (-)
Gene ID: HRGMv2_4626_11_44
Type: pfam
Location: 64006 - 65181 (-)
Gene ID: HRGMv2_4626_11_45
Type: TC
Location: 65369 - 65701 (-)
Gene ID: HRGMv2_4626_11_46
Type: CAZyme
Location: 65847 - 67124 (+)
Gene ID: HRGMv2_4626_11_47
Type: pfam
Location: 67121 - 71809 (-)
Gene ID: HRGMv2_4626_11_48
Type: TC
Location: 71968 - 72597 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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