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Cluster: HRGMv2_3678_CGC8

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_65 66618 67346 + GT26
pfam HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_66 67363 68001 + PS_Dcarbxylase
pfam HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_67 67998 68672 + CDP-OH_P_transf
CAZyme HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_68 68694 69944 + GT2
pfam HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_69 69953 70708 + SurE
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_70 71123 72508 + 2.A.25.1.4
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_71 73429 75894 + 1.B.23.1.5
TF HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_72 75999 76250 + HTH_3
STP HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_73 76345 76848 + Nitroreductase | Nitroreductase
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_74 76910 77113 + 2.A.64.3.1
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_75 77088 77819 + 2.A.64.1.3
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_76 77988 81425 + 3.B.1.1.1
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_77 81596 82795 - 2.A.1.2.20
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_78 83002 83934 + 3.A.1.5.2
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_79 83937 84851 + 3.A.1.5.2
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_80 84848 85843 + 3.A.1.5.2
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_81 85830 86798 + 3.A.1.5.41
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_82 86798 88372 + 3.A.1.5.2
peptidase HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_83 88396 89325 + S66.UPW
peptidase HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_84 89368 90561 + M20.UPD
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_85 90680 92074 - 2.A.40.7.6
pfam HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_86 92238 96542 - BcrAD_BadFG | BcrAD_BadFG | DUF2229 | DUF2229
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_87 97226 98680 - 2.A.111.1.1
pfam HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_88 98951 99397 + Usp
TC HRGMv2_3678_4 HRGMv2_3678_4_89 99614 101374 + 9.B.8.4.2
Gene ID: HRGMv2_3678_4_65
Type: CAZyme
Location: 66618 - 67346 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_66
Type: pfam
Location: 67363 - 68001 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_67
Type: pfam
Location: 67998 - 68672 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_68
Type: CAZyme
Location: 68694 - 69944 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_69
Type: pfam
Location: 69953 - 70708 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_70
Type: TC
Location: 71123 - 72508 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_71
Type: TC
Location: 73429 - 75894 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_72
Type: TF
Location: 75999 - 76250 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_73
Type: STP
Location: 76345 - 76848 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_74
Type: TC
Location: 76910 - 77113 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_75
Type: TC
Location: 77088 - 77819 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_76
Type: TC
Location: 77988 - 81425 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_77
Type: TC
Location: 81596 - 82795 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_78
Type: TC
Location: 83002 - 83934 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_79
Type: TC
Location: 83937 - 84851 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_80
Type: TC
Location: 84848 - 85843 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_81
Type: TC
Location: 85830 - 86798 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_82
Type: TC
Location: 86798 - 88372 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_83
Type: peptidase
Location: 88396 - 89325 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_84
Type: peptidase
Location: 89368 - 90561 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_85
Type: TC
Location: 90680 - 92074 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_86
Type: pfam
Location: 92238 - 96542 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_87
Type: TC
Location: 97226 - 98680 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_88
Type: pfam
Location: 98951 - 99397 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_4_89
Type: TC
Location: 99614 - 101374 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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