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Cluster: HRGMv2_3678_CGC18

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_54 56111 56860 - 3.A.1.3.13
TC HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_55 56878 57585 - 3.A.1.3.13
TC HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_56 57602 58396 - 3.A.1.3.13
TC HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_57 58416 59279 - 3.A.1.3.14
pfam HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_58 59320 60318 - URO-D
pfam HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_59 60742 61512 - adh_short | adh_short_C2
CAZyme HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_60 61651 63051 + AA4
TC HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_61 63169 64329 - 2.A.1.60.3
TF HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_62 64557 65330 - HTH_AraC | HTH_AraC
TC HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_63 65317 67035 - 8.A.59.2.1
TC HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_64 67062 68729 - 3.A.1.20.1
TC HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_65 68713 69822 - 3.A.1.20.1
TC HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_66 69908 70954 - 3.A.1.20.1
TC HRGMv2_3678_10 HRGMv2_3678_10_67 71440 72264 + 3.A.1.24.5
Gene ID: HRGMv2_3678_10_54
Type: TC
Location: 56111 - 56860 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_55
Type: TC
Location: 56878 - 57585 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_56
Type: TC
Location: 57602 - 58396 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_57
Type: TC
Location: 58416 - 59279 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_58
Type: pfam
Location: 59320 - 60318 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_59
Type: pfam
Location: 60742 - 61512 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_60
Type: CAZyme
Location: 61651 - 63051 (+)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_61
Type: TC
Location: 63169 - 64329 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_62
Type: TF
Location: 64557 - 65330 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_63
Type: TC
Location: 65317 - 67035 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_64
Type: TC
Location: 67062 - 68729 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_65
Type: TC
Location: 68713 - 69822 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_66
Type: TC
Location: 69908 - 70954 (-)
Gene ID: HRGMv2_3678_10_67
Type: TC
Location: 71440 - 72264 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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