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Cluster: HRGMv2_3292_CGC5

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_310 363221 364036 + 3.A.1.24.1
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_311 364033 365148 + 3.A.1.24.2
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_312 365138 365782 + 3.A.1.24.5
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_313 365785 366888 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_314 367065 367691 + Methyltransf_11 | Methyltransf_12 | Methyltransf_23 | Methyltransf_25 | Methyltransf_31
CAZyme HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_315 367800 369989 - GH129
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_316 370208 373273 - 2.A.6.2.27
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_317 373270 374340 - 2.A.6.2.27
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_318 374337 375419 - 2.A.6.2.27
pfam HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_319 375541 376704 + AAA_15 | AAA_21 | AAA_21
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_320 376817 377665 - 3.A.1.3.27
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_321 377662 378438 - 3.A.1.3.9
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_322 378435 379094 - 3.A.1.3.2
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_323 379075 379740 - 3.A.1.3.2
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_324 380105 380887 - 3.A.1.24.5
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_325 380994 381920 - 3.A.23.1.1
pfam HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_326 381968 382549 - Ser_hydrolase
pfam HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_327 382742 385672 - Gly_transf_sug | TcdA_TcdB | ToxA_N
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_328 385859 386260 - 1.A.30.2.7
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_329 386262 386981 - 1.A.30.2.7
Gene ID: HRGMv2_3292_1_310
Type: TC
Location: 363221 - 364036 (+)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_311
Type: TC
Location: 364033 - 365148 (+)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_312
Type: TC
Location: 365138 - 365782 (+)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_313
Type:
Location: 365785 - 366888 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_314
Type: pfam
Location: 367065 - 367691 (+)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_315
Type: CAZyme
Location: 367800 - 369989 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_316
Type: TC
Location: 370208 - 373273 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_317
Type: TC
Location: 373270 - 374340 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_318
Type: TC
Location: 374337 - 375419 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_319
Type: pfam
Location: 375541 - 376704 (+)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_320
Type: TC
Location: 376817 - 377665 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_321
Type: TC
Location: 377662 - 378438 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_322
Type: TC
Location: 378435 - 379094 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_323
Type: TC
Location: 379075 - 379740 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_324
Type: TC
Location: 380105 - 380887 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_325
Type: TC
Location: 380994 - 381920 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_326
Type: pfam
Location: 381968 - 382549 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_327
Type: pfam
Location: 382742 - 385672 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_328
Type: TC
Location: 385859 - 386260 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_329
Type: TC
Location: 386262 - 386981 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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