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Cluster: HRGMv2_3292_CGC3

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_180 217313 217591 + 2.A.64.1.1
pfam HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_181 217602 218009 + TatA_B_E
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_182 218006 218797 + 2.A.64.1.1
pfam HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_183 218794 219501 + Methyltrans_RNA
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_184 219725 221641 + 1.B.52.2.1
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_185 221777 223684 + 1.B.52.2.1
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_186 223794 224528 - 3.A.1.3.22
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_187 224521 225480 - 3.A.1.3.17
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_188 225611 226411 - 3.A.1.3.27
TC HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_189 226628 227428 - 3.A.1.3.3
CAZyme HRGMv2_3292_1 HRGMv2_3292_1_190 227616 230186 - GT2
Gene ID: HRGMv2_3292_1_180
Type: TC
Location: 217313 - 217591 (+)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_181
Type: pfam
Location: 217602 - 218009 (+)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_182
Type: TC
Location: 218006 - 218797 (+)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_183
Type: pfam
Location: 218794 - 219501 (+)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_184
Type: TC
Location: 219725 - 221641 (+)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_185
Type: TC
Location: 221777 - 223684 (+)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_186
Type: TC
Location: 223794 - 224528 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_187
Type: TC
Location: 224521 - 225480 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_188
Type: TC
Location: 225611 - 226411 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_189
Type: TC
Location: 226628 - 227428 (-)
Gene ID: HRGMv2_3292_1_190
Type: CAZyme
Location: 227616 - 230186 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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