dbCAN Logo

Cluster: HRGMv2_3194_CGC9

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_90 111029 111829 + 3.A.1.103.6
TC HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_91 111844 112614 + 3.A.1.103.1
CAZyme HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_92 112636 114504 + GT2
pfam HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_93 114516 114764 + FakA-like_M
CAZyme HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_94 114771 116609 + GT2 | GT2
pfam HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_95 116681 117082 - ATP-synt_DE | ATP-synt_DE_N
TC HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_96 117079 118479 - 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_97 118525 119370 - 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_98 119392 120906 - 3.A.2.1.5
pfam HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_99 120919 121458 - OSCP
pfam HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_100 121455 121955 - ATP-synt_B
TC HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_101 121999 122277 - 3.A.2.1.2
TC HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_102 122326 123072 - 3.A.2.1.5
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_103 123077 123502 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_104 123530 123793 - ATPase_gene1
TC HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_105 124064 125950 - 3.A.1.135.5
TC HRGMv2_3194_3 HRGMv2_3194_3_106 125967 127706 - 3.A.1.135.5
Gene ID: HRGMv2_3194_3_90
Type: TC
Location: 111029 - 111829 (+)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_91
Type: TC
Location: 111844 - 112614 (+)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_92
Type: CAZyme
Location: 112636 - 114504 (+)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_93
Type: pfam
Location: 114516 - 114764 (+)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_94
Type: CAZyme
Location: 114771 - 116609 (+)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_95
Type: pfam
Location: 116681 - 117082 (-)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_96
Type: TC
Location: 117079 - 118479 (-)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_97
Type: TC
Location: 118525 - 119370 (-)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_98
Type: TC
Location: 119392 - 120906 (-)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_99
Type: pfam
Location: 120919 - 121458 (-)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_100
Type: pfam
Location: 121455 - 121955 (-)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_101
Type: TC
Location: 121999 - 122277 (-)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_102
Type: TC
Location: 122326 - 123072 (-)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_103
Type:
Location: 123077 - 123502 (-)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_104
Type: pfam
Location: 123530 - 123793 (-)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_105
Type: TC
Location: 124064 - 125950 (-)
Gene ID: HRGMv2_3194_3_106
Type: TC
Location: 125967 - 127706 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List