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Cluster: HRGMv2_3185_CGC45

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3185_18 HRGMv2_3185_18_21 23023 24045 + 2.A.56.1.5
TC HRGMv2_3185_18 HRGMv2_3185_18_22 24124 24603 + 2.A.56.1.5
TC HRGMv2_3185_18 HRGMv2_3185_18_23 24603 25919 + 2.A.56.1.5
CAZyme HRGMv2_3185_18 HRGMv2_3185_18_24 26049 28541 + GH31_2
CAZyme HRGMv2_3185_18 HRGMv2_3185_18_25 28563 31079 + GH31_2
pfam HRGMv2_3185_18 HRGMv2_3185_18_26 31151 31906 - TraX
pfam HRGMv2_3185_18 HRGMv2_3185_18_27 32047 32856 - Lactamase_B | Lactamase_B_2
TC HRGMv2_3185_18 HRGMv2_3185_18_28 33243 34292 + 2.A.56.1.5
TC HRGMv2_3185_18 HRGMv2_3185_18_29 34289 34777 + 2.A.56.1.5
TC HRGMv2_3185_18 HRGMv2_3185_18_30 34781 36082 + 2.A.56.1.5
Gene ID: HRGMv2_3185_18_21
Type: TC
Location: 23023 - 24045 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_18_22
Type: TC
Location: 24124 - 24603 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_18_23
Type: TC
Location: 24603 - 25919 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_18_24
Type: CAZyme
Location: 26049 - 28541 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_18_25
Type: CAZyme
Location: 28563 - 31079 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_18_26
Type: pfam
Location: 31151 - 31906 (-)
Gene ID: HRGMv2_3185_18_27
Type: pfam
Location: 32047 - 32856 (-)
Gene ID: HRGMv2_3185_18_28
Type: TC
Location: 33243 - 34292 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_18_29
Type: TC
Location: 34289 - 34777 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_18_30
Type: TC
Location: 34781 - 36082 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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