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Cluster: HRGMv2_3185_CGC2

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3185_1 HRGMv2_3185_1_28 31224 32930 + 4.A.1.2.6
CAZyme HRGMv2_3185_1 HRGMv2_3185_1_29 33030 34472 + GH1
pfam HRGMv2_3185_1 HRGMv2_3185_1_30 34571 35416 + Hydrolase_3
STP HRGMv2_3185_1 HRGMv2_3185_1_31 35620 35877 + PTS-HPr
TC HRGMv2_3185_1 HRGMv2_3185_1_32 35960 37639 + 8.A.7.1.1
TF HRGMv2_3185_1 HRGMv2_3185_1_33 37709 38512 - MerR
TC HRGMv2_3185_1 HRGMv2_3185_1_34 38645 42934 + 9.B.34.1.1
TC HRGMv2_3185_1 HRGMv2_3185_1_35 43139 44488 + 2.A.66.1.7
Gene ID: HRGMv2_3185_1_28
Type: TC
Location: 31224 - 32930 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_1_29
Type: CAZyme
Location: 33030 - 34472 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_1_30
Type: pfam
Location: 34571 - 35416 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_1_31
Type: STP
Location: 35620 - 35877 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_1_32
Type: TC
Location: 35960 - 37639 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_1_33
Type: TF
Location: 37709 - 38512 (-)
Gene ID: HRGMv2_3185_1_34
Type: TC
Location: 38645 - 42934 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_1_35
Type: TC
Location: 43139 - 44488 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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