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Cluster: HRGMv2_3185_CGC17

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3185_6 HRGMv2_3185_6_54 52586 54628 + 3.A.11.1.1
peptidase HRGMv2_3185_6 HRGMv2_3185_6_55 54731 56068 + S11.004
pfam HRGMv2_3185_6 HRGMv2_3185_6_56 56136 56390 - IreB
CAZyme HRGMv2_3185_6 HRGMv2_3185_6_57 56535 57665 - CE9
sulfatase HRGMv2_3185_6 HRGMv2_3185_6_58 57736 58461 - S1_9
TC HRGMv2_3185_6 HRGMv2_3185_6_59 58744 60219 - 4.A.1.1.7
pfam HRGMv2_3185_6 HRGMv2_3185_6_60 60573 61298 - DNA_alkylation
pfam HRGMv2_3185_6 HRGMv2_3185_6_61 61448 62008 - Thia_YuaJ
CAZyme HRGMv2_3185_6 HRGMv2_3185_6_62 62235 63947 - GH13_9
CAZyme HRGMv2_3185_6 HRGMv2_3185_6_63 64247 66277 + GH25
Gene ID: HRGMv2_3185_6_54
Type: TC
Location: 52586 - 54628 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_6_55
Type: peptidase
Location: 54731 - 56068 (+)
Gene ID: HRGMv2_3185_6_56
Type: pfam
Location: 56136 - 56390 (-)
Gene ID: HRGMv2_3185_6_57
Type: CAZyme
Location: 56535 - 57665 (-)
Gene ID: HRGMv2_3185_6_58
Type: sulfatase
Location: 57736 - 58461 (-)
Gene ID: HRGMv2_3185_6_59
Type: TC
Location: 58744 - 60219 (-)
Gene ID: HRGMv2_3185_6_60
Type: pfam
Location: 60573 - 61298 (-)
Gene ID: HRGMv2_3185_6_61
Type: pfam
Location: 61448 - 62008 (-)
Gene ID: HRGMv2_3185_6_62
Type: CAZyme
Location: 62235 - 63947 (-)
Gene ID: HRGMv2_3185_6_63
Type: CAZyme
Location: 64247 - 66277 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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