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Cluster: HRGMv2_3176_CGC12

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_3176_2 HRGMv2_3176_2_317 354076 355206 - GH105
TC HRGMv2_3176_2 HRGMv2_3176_2_318 355203 356045 - 3.A.1.1.11
TC HRGMv2_3176_2 HRGMv2_3176_2_319 356042 356938 - 3.A.1.1.11
TC HRGMv2_3176_2 HRGMv2_3176_2_320 356935 358260 - 3.A.1.1.11
pfam HRGMv2_3176_2 HRGMv2_3176_2_321 358449 360539 - Gln-synt_C | GSIII_N | Gln-synt_C-ter
STP HRGMv2_3176_2 HRGMv2_3176_2_322 360774 362384 - CbiA
TC HRGMv2_3176_2 HRGMv2_3176_2_323 362593 364380 - 1.A.11.2.7
Gene ID: HRGMv2_3176_2_317
Type: CAZyme
Location: 354076 - 355206 (-)
Gene ID: HRGMv2_3176_2_318
Type: TC
Location: 355203 - 356045 (-)
Gene ID: HRGMv2_3176_2_319
Type: TC
Location: 356042 - 356938 (-)
Gene ID: HRGMv2_3176_2_320
Type: TC
Location: 356935 - 358260 (-)
Gene ID: HRGMv2_3176_2_321
Type: pfam
Location: 358449 - 360539 (-)
Gene ID: HRGMv2_3176_2_322
Type: STP
Location: 360774 - 362384 (-)
Gene ID: HRGMv2_3176_2_323
Type: TC
Location: 362593 - 364380 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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