dbCAN Logo

Cluster: HRGMv2_3158_CGC4

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_63 66362 67594 + 2.A.86.1.8
TC HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_64 67909 69588 + 3.A.1.5.19
TC HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_65 69861 70802 + 3.A.1.5.19
TC HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_66 70795 71895 + 3.A.1.5.19
TC HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_67 71909 73003 + 3.A.1.5.19
TC HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_68 72996 73946 + 3.A.1.5.25
TC HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_69 74210 75751 + 3.A.1.5.27
TC HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_70 75814 76752 + 3.A.1.5.32
TC HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_71 76794 77672 + 3.A.1.5.27
TC HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_72 77691 78479 + 3.A.1.5.34
TC HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_73 78526 79263 + 3.A.1.5.29
TF HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_74 79390 79587 - HTH_3
pfam HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_75 79580 79933 - DUF3796
CAZyme HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_76 80185 81204 - GT2
pfam HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_77 81201 82151 - SUFBD_core
TC HRGMv2_3158_4 HRGMv2_3158_4_78 82148 82888 - 3.A.1.20.2
Gene ID: HRGMv2_3158_4_63
Type: TC
Location: 66362 - 67594 (+)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_64
Type: TC
Location: 67909 - 69588 (+)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_65
Type: TC
Location: 69861 - 70802 (+)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_66
Type: TC
Location: 70795 - 71895 (+)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_67
Type: TC
Location: 71909 - 73003 (+)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_68
Type: TC
Location: 72996 - 73946 (+)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_69
Type: TC
Location: 74210 - 75751 (+)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_70
Type: TC
Location: 75814 - 76752 (+)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_71
Type: TC
Location: 76794 - 77672 (+)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_72
Type: TC
Location: 77691 - 78479 (+)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_73
Type: TC
Location: 78526 - 79263 (+)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_74
Type: TF
Location: 79390 - 79587 (-)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_75
Type: pfam
Location: 79580 - 79933 (-)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_76
Type: CAZyme
Location: 80185 - 81204 (-)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_77
Type: pfam
Location: 81201 - 82151 (-)
Gene ID: HRGMv2_3158_4_78
Type: TC
Location: 82148 - 82888 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_3158_4_65 vegan > omnivore 1.09458 0.00701

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List