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Cluster: HRGMv2_3132_CGC5

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_28 31914 32852 + 3.A.1.122.2
pfam HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_29 32836 34419 + NPCBM_assoc
TC HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_30 34406 35872 + 3.A.1.122.10
pfam HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_31 36048 36323 + Trns_repr_metal
CAZyme HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_32 36678 38141 - CE4
pfam HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_33 38352 40022 + tRNA-synt_1c | tRNA-synt_1c_C | tRNA-synt_1c_C2
pfam HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_34 40074 41531 + tRNA-synt_1c | Anticodon_2
TC HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_35 41627 43069 + 2.A.118.1.4
TC HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_36 43216 43914 + 9.B.143.2.3
STP HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_37 44248 44553 - Pyr_redox
peptidase HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_38 45179 46264 + G05.UPW
TC HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_39 47696 49567 + 3.A.3.6.16
TF HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_40 49923 50723 + MerR
TC HRGMv2_3132_3 HRGMv2_3132_3_41 50720 51535 + 3.A.1.105.14
Gene ID: HRGMv2_3132_3_28
Type: TC
Location: 31914 - 32852 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_29
Type: pfam
Location: 32836 - 34419 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_30
Type: TC
Location: 34406 - 35872 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_31
Type: pfam
Location: 36048 - 36323 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_32
Type: CAZyme
Location: 36678 - 38141 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_33
Type: pfam
Location: 38352 - 40022 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_34
Type: pfam
Location: 40074 - 41531 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_35
Type: TC
Location: 41627 - 43069 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_36
Type: TC
Location: 43216 - 43914 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_37
Type: STP
Location: 44248 - 44553 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_38
Type: peptidase
Location: 45179 - 46264 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_39
Type: TC
Location: 47696 - 49567 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_40
Type: TF
Location: 49923 - 50723 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_3_41
Type: TC
Location: 50720 - 51535 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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