dbCAN Logo

Cluster: HRGMv2_3132_CGC4

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_32 33356 34453 - GH177
pfam HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_33 34469 35578 - NAD_synthase
pfam HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_34 35770 37083 - UDPG_MGDP_dh | NAD_binding_2 | UDPG_MGDP_dh_C | UDPG_MGDP_dh_N
CAZyme HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_35 37115 38191 - GT4
CAZyme HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_36 38192 39217 - GT4
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_37 39219 40322 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_38 40328 40894 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
CAZyme HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_39 40891 41994 - GT4
TC HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_40 42014 43405 - 9.B.18.1.1
TC HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_41 44163 45200 - 3.A.1.5.29
TC HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_42 45203 46204 - 3.A.1.5.20
TC HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_43 46221 47135 - 3.A.1.5.20
TC HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_44 47151 48065 - 3.A.1.5.20
TC HRGMv2_3132_2 HRGMv2_3132_2_45 48306 49889 - 3.A.1.5.27
Gene ID: HRGMv2_3132_2_32
Type: CAZyme
Location: 33356 - 34453 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_33
Type: pfam
Location: 34469 - 35578 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_34
Type: pfam
Location: 35770 - 37083 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_35
Type: CAZyme
Location: 37115 - 38191 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_36
Type: CAZyme
Location: 38192 - 39217 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_37
Type:
Location: 39219 - 40322 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_38
Type:
Location: 40328 - 40894 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_39
Type: CAZyme
Location: 40891 - 41994 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_40
Type: TC
Location: 42014 - 43405 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_41
Type: TC
Location: 44163 - 45200 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_42
Type: TC
Location: 45203 - 46204 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_43
Type: TC
Location: 46221 - 47135 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_44
Type: TC
Location: 47151 - 48065 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_2_45
Type: TC
Location: 48306 - 49889 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List