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Cluster: HRGMv2_3132_CGC2

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3132_1 HRGMv2_3132_1_198 225060 226586 + 3.A.1.2.20
TC HRGMv2_3132_1 HRGMv2_3132_1_199 226576 227538 + 3.A.1.2.1
CAZyme HRGMv2_3132_1 HRGMv2_3132_1_200 227560 228558 + GH179
pfam HRGMv2_3132_1 HRGMv2_3132_1_201 228584 229438 + AP_endonuc_2
CAZyme HRGMv2_3132_1 HRGMv2_3132_1_202 229583 231856 - GH2
TC HRGMv2_3132_1 HRGMv2_3132_1_203 231892 232716 - 3.A.1.1.4
TC HRGMv2_3132_1 HRGMv2_3132_1_204 232716 233612 - 3.A.1.1.4
TC HRGMv2_3132_1 HRGMv2_3132_1_205 233932 235236 - 3.A.1.1.4
Gene ID: HRGMv2_3132_1_198
Type: TC
Location: 225060 - 226586 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_1_199
Type: TC
Location: 226576 - 227538 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_1_200
Type: CAZyme
Location: 227560 - 228558 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_1_201
Type: pfam
Location: 228584 - 229438 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_1_202
Type: CAZyme
Location: 229583 - 231856 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_1_203
Type: TC
Location: 231892 - 232716 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_1_204
Type: TC
Location: 232716 - 233612 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_1_205
Type: TC
Location: 233932 - 235236 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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