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Cluster: HRGMv2_3132_CGC15

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3132_11 HRGMv2_3132_11_6 3735 4817 - 1.A.23.4.3
pfam HRGMv2_3132_11 HRGMv2_3132_11_7 5303 5866 + ECF_trnsprt
sulfatase HRGMv2_3132_11 HRGMv2_3132_11_8 6142 7287 + S1_2
CAZyme HRGMv2_3132_11 HRGMv2_3132_11_9 7586 9532 + GT2
CAZyme HRGMv2_3132_11 HRGMv2_3132_11_10 9529 11160 + GT2
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_3132_11 HRGMv2_3132_11_11 11223 11564 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_3132_11 HRGMv2_3132_11_12 11587 13797 + 3.A.7.16.1
STP HRGMv2_3132_11 HRGMv2_3132_11_13 13794 14462 + Pribosyltran
pfam HRGMv2_3132_11 HRGMv2_3132_11_14 14571 15722 - DHHW | ALGX
TC HRGMv2_3132_11 HRGMv2_3132_11_15 15742 17157 - 2.A.50.2.1
Gene ID: HRGMv2_3132_11_6
Type: TC
Location: 3735 - 4817 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_11_7
Type: pfam
Location: 5303 - 5866 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_11_8
Type: sulfatase
Location: 6142 - 7287 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_11_9
Type: CAZyme
Location: 7586 - 9532 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_11_10
Type: CAZyme
Location: 9529 - 11160 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_11_11
Type:
Location: 11223 - 11564 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_11_12
Type: TC
Location: 11587 - 13797 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_11_13
Type: STP
Location: 13794 - 14462 (+)
Gene ID: HRGMv2_3132_11_14
Type: pfam
Location: 14571 - 15722 (-)
Gene ID: HRGMv2_3132_11_15
Type: TC
Location: 15742 - 17157 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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