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Cluster: HRGMv2_3130_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_3130_1 HRGMv2_3130_1_35 40592 42817 - GH3
TC HRGMv2_3130_1 HRGMv2_3130_1_36 42973 44064 - 3.A.1.11.7
TC HRGMv2_3130_1 HRGMv2_3130_1_37 44061 44855 - 3.A.1.11.2
TC HRGMv2_3130_1 HRGMv2_3130_1_38 44860 45699 - 3.A.1.11.1
TC HRGMv2_3130_1 HRGMv2_3130_1_39 45714 47282 - 3.A.1.11.8
TF HRGMv2_3130_1 HRGMv2_3130_1_40 47330 47863 - HTH_3
TC HRGMv2_3130_1 HRGMv2_3130_1_41 48479 49648 + 3.A.1.2.17
TC HRGMv2_3130_1 HRGMv2_3130_1_42 49731 51287 + 3.A.1.2.17
TC HRGMv2_3130_1 HRGMv2_3130_1_43 51284 52372 + 3.A.1.2.10
TC HRGMv2_3130_1 HRGMv2_3130_1_44 52365 53357 + 3.A.1.2.17
Gene ID: HRGMv2_3130_1_35
Type: CAZyme
Location: 40592 - 42817 (-)
Gene ID: HRGMv2_3130_1_36
Type: TC
Location: 42973 - 44064 (-)
Gene ID: HRGMv2_3130_1_37
Type: TC
Location: 44061 - 44855 (-)
Gene ID: HRGMv2_3130_1_38
Type: TC
Location: 44860 - 45699 (-)
Gene ID: HRGMv2_3130_1_39
Type: TC
Location: 45714 - 47282 (-)
Gene ID: HRGMv2_3130_1_40
Type: TF
Location: 47330 - 47863 (-)
Gene ID: HRGMv2_3130_1_41
Type: TC
Location: 48479 - 49648 (+)
Gene ID: HRGMv2_3130_1_42
Type: TC
Location: 49731 - 51287 (+)
Gene ID: HRGMv2_3130_1_43
Type: TC
Location: 51284 - 52372 (+)
Gene ID: HRGMv2_3130_1_44
Type: TC
Location: 52365 - 53357 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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