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Cluster: HRGMv2_2845_CGC23

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2845_41 HRGMv2_2845_41_5 2268 3365 + 3.A.7.19.1
TF HRGMv2_2845_41 HRGMv2_2845_41_6 3547 4584 + LacI
CAZyme HRGMv2_2845_41 HRGMv2_2845_41_7 4593 6278 + CBM34 | GH13_20
TC HRGMv2_2845_41 HRGMv2_2845_41_8 6374 7684 + 3.A.1.1.22
TC HRGMv2_2845_41 HRGMv2_2845_41_9 7762 9072 + 3.A.1.1.6
TC HRGMv2_2845_41 HRGMv2_2845_41_10 9069 9941 + 3.A.1.1.6
CAZyme HRGMv2_2845_41 HRGMv2_2845_41_11 9943 11859 + GH31_15
CAZyme HRGMv2_2845_41 HRGMv2_2845_41_12 11927 14134 + CBM20 | GH13_2
Gene ID: HRGMv2_2845_41_5
Type: TC
Location: 2268 - 3365 (+)
Gene ID: HRGMv2_2845_41_6
Type: TF
Location: 3547 - 4584 (+)
Gene ID: HRGMv2_2845_41_7
Type: CAZyme
Location: 4593 - 6278 (+)
Gene ID: HRGMv2_2845_41_8
Type: TC
Location: 6374 - 7684 (+)
Gene ID: HRGMv2_2845_41_9
Type: TC
Location: 7762 - 9072 (+)
Gene ID: HRGMv2_2845_41_10
Type: TC
Location: 9069 - 9941 (+)
Gene ID: HRGMv2_2845_41_11
Type: CAZyme
Location: 9943 - 11859 (+)
Gene ID: HRGMv2_2845_41_12
Type: CAZyme
Location: 11927 - 14134 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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