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Cluster: HRGMv2_2712_CGC3

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2712_1 HRGMv2_2712_1_614 651126 652118 + 3.A.1.24.2
TC HRGMv2_2712_1 HRGMv2_2712_1_615 652123 652800 + 3.A.1.24.5
TC HRGMv2_2712_1 HRGMv2_2712_1_616 652946 653797 + 3.A.1.24.5
pfam HRGMv2_2712_1 HRGMv2_2712_1_617 653863 654846 - NMT1 | NMT1_2 | NMT1_2
TC HRGMv2_2712_1 HRGMv2_2712_1_618 654843 655658 - 3.A.1.17.3
TC HRGMv2_2712_1 HRGMv2_2712_1_619 655651 656409 - 3.A.1.17.8
CAZyme HRGMv2_2712_1 HRGMv2_2712_1_620 656541 657404 - CE4
TC HRGMv2_2712_1 HRGMv2_2712_1_621 657459 660101 - 3.A.3.2.21
Gene ID: HRGMv2_2712_1_614
Type: TC
Location: 651126 - 652118 (+)
Gene ID: HRGMv2_2712_1_615
Type: TC
Location: 652123 - 652800 (+)
Gene ID: HRGMv2_2712_1_616
Type: TC
Location: 652946 - 653797 (+)
Gene ID: HRGMv2_2712_1_617
Type: pfam
Location: 653863 - 654846 (-)
Gene ID: HRGMv2_2712_1_618
Type: TC
Location: 654843 - 655658 (-)
Gene ID: HRGMv2_2712_1_619
Type: TC
Location: 655651 - 656409 (-)
Gene ID: HRGMv2_2712_1_620
Type: CAZyme
Location: 656541 - 657404 (-)
Gene ID: HRGMv2_2712_1_621
Type: TC
Location: 657459 - 660101 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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