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Cluster: HRGMv2_2552_CGC8

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2552_11 HRGMv2_2552_11_1 217 1557 - 2.A.40.3.1
peptidase HRGMv2_2552_11 HRGMv2_2552_11_2 1557 2603 - M38.UPW
TC HRGMv2_2552_11 HRGMv2_2552_11_3 3241 4521 + 4.A.3.2.2
pfam HRGMv2_2552_11 HRGMv2_2552_11_4 4600 5418 + Hydrolase | S6PP | Hydrolase_3
pfam HRGMv2_2552_11 HRGMv2_2552_11_5 5727 6578 + PRD | PRD | CAT_RBD
TC HRGMv2_2552_11 HRGMv2_2552_11_6 6592 6942 + 4.A.3.1.3
TC HRGMv2_2552_11 HRGMv2_2552_11_7 6961 8658 + 4.A.3.1.3
CAZyme HRGMv2_2552_11 HRGMv2_2552_11_8 8673 10094 + GH1
pfam HRGMv2_2552_11 HRGMv2_2552_11_9 10360 11214 + PRD | PRD | CAT_RBD
TC HRGMv2_2552_11 HRGMv2_2552_11_10 11227 11577 + 4.A.3.1.3
TC HRGMv2_2552_11 HRGMv2_2552_11_11 11632 13368 + 4.A.3.1.2
CAZyme HRGMv2_2552_11 HRGMv2_2552_11_12 13365 14792 + GH1
Gene ID: HRGMv2_2552_11_1
Type: TC
Location: 217 - 1557 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_11_2
Type: peptidase
Location: 1557 - 2603 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_11_3
Type: TC
Location: 3241 - 4521 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_11_4
Type: pfam
Location: 4600 - 5418 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_11_5
Type: pfam
Location: 5727 - 6578 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_11_6
Type: TC
Location: 6592 - 6942 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_11_7
Type: TC
Location: 6961 - 8658 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_11_8
Type: CAZyme
Location: 8673 - 10094 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_11_9
Type: pfam
Location: 10360 - 11214 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_11_10
Type: TC
Location: 11227 - 11577 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_11_11
Type: TC
Location: 11632 - 13368 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_11_12
Type: CAZyme
Location: 13365 - 14792 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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