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Cluster: HRGMv2_2552_CGC2

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_26 29369 30121 - 1.A.8.2.7
sulfatase HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_27 30498 31304 + S1_8
pfam HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_28 31374 31808 - MaoC_dehydratas | FAS1_DH_region
TC HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_29 32145 33065 + 8.A.5.1.7
pfam HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_30 33178 33804 + Flavodoxin_2 | FMN_red
CAZyme HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_31 33852 35246 - GH1
pfam HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_32 35249 36133 - ROK
CAZyme HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_33 36126 37613 - CE20
TC HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_34 37606 37944 - 4.A.3.1.2
TC HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_35 37957 39381 - 4.A.3.2.2
pfam HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_36 39383 39691 - PTS_IIB
TF HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_37 39913 40608 - GntR
CAZyme HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_38 40799 42472 - GH13_31
TC HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_39 42547 43296 - 9.B.141.1.2
pfam HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_40 43297 44367 - YibE_F
TC HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_41 44747 45754 + 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_42 45751 46641 + 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_2552_2 HRGMv2_2552_2_43 46638 47387 + 3.A.1.34.1
Gene ID: HRGMv2_2552_2_26
Type: TC
Location: 29369 - 30121 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_27
Type: sulfatase
Location: 30498 - 31304 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_28
Type: pfam
Location: 31374 - 31808 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_29
Type: TC
Location: 32145 - 33065 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_30
Type: pfam
Location: 33178 - 33804 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_31
Type: CAZyme
Location: 33852 - 35246 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_32
Type: pfam
Location: 35249 - 36133 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_33
Type: CAZyme
Location: 36126 - 37613 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_34
Type: TC
Location: 37606 - 37944 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_35
Type: TC
Location: 37957 - 39381 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_36
Type: pfam
Location: 39383 - 39691 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_37
Type: TF
Location: 39913 - 40608 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_38
Type: CAZyme
Location: 40799 - 42472 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_39
Type: TC
Location: 42547 - 43296 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_40
Type: pfam
Location: 43297 - 44367 (-)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_41
Type: TC
Location: 44747 - 45754 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_42
Type: TC
Location: 45751 - 46641 (+)
Gene ID: HRGMv2_2552_2_43
Type: TC
Location: 46638 - 47387 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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