Cluster: HRGMv2_2451_CGC5

🧬 Cluster Details

Gene Type	Contig ID	Protein ID	Start	Stop	Direction	Protein Family
TC	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_126	156787	157707	+	3.A.1.122.2
NULL(UNKNOWN)	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_127	157704	159455	+	NULL(UNKNOWN) [View Structural Homologs]
TC	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_128	159472	160728	+	3.A.1.122.2
NULL(UNKNOWN)	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_129	160827	161072	-	NULL(UNKNOWN) [View Structural Homologs]
pfam	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_130	161442	162722	+	tRNA-synt_2b \| Seryl_tRNA_N
TC	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_131	163187	163879	+	3.A.2.1.5
TC	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_132	163931	164155	+	3.A.2.1.2
pfam	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_133	164226	164729	+	ATP-synt_B
pfam	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_134	164710	165213	+	OSCP
TC	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_135	165219	166730	+	3.A.2.1.5
TC	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_136	166764	167666	+	3.A.2.1.5
TC	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_137	167683	169086	+	3.A.2.1.5
TC	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_138	169090	169554	+	3.A.2.1.5
pfam	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_139	169825	170214	+	DUF6483
TC	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_140	170426	171439	+	8.A.21.2.4
pfam	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_141	171420	172205	+	RDD
pfam	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_142	172332	172787	+	Acetyltransf_1 \| Acetyltransf_7 \| Acetyltransf_10
TC	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_143	172916	175498	+	3.A.9.1.2
pfam	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_144	175688	179011	+	Viral_helicase1
pfam	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_145	179338	180186	+	Metallophos
CAZyme	HRGMv2_2451_1	HRGMv2_2451_1_146	180248	180946	+	CE4

Gene ID: HRGMv2_2451_1_126
Type: TC
Location: 156787 - 157707 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_127
Type:
Location: 157704 - 159455 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_128
Type: TC
Location: 159472 - 160728 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_129
Type:
Location: 160827 - 161072 (-)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_130
Type: pfam
Location: 161442 - 162722 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_131
Type: TC
Location: 163187 - 163879 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_132
Type: TC
Location: 163931 - 164155 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_133
Type: pfam
Location: 164226 - 164729 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_134
Type: pfam
Location: 164710 - 165213 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_135
Type: TC
Location: 165219 - 166730 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_136
Type: TC
Location: 166764 - 167666 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_137
Type: TC
Location: 167683 - 169086 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_138
Type: TC
Location: 169090 - 169554 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_139
Type: pfam
Location: 169825 - 170214 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_140
Type: TC
Location: 170426 - 171439 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_141
Type: pfam
Location: 171420 - 172205 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_142
Type: pfam
Location: 172332 - 172787 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_143
Type: TC
Location: 172916 - 175498 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_144
Type: pfam
Location: 175688 - 179011 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_145
Type: pfam
Location: 179338 - 180186 (+)

Gene ID: HRGMv2_2451_1_146
Type: CAZyme
Location: 180248 - 180946 (+)

Taxonomic Lineage

Domain

→

Phylum

→

Class

→

Order

→

Family

→

Gene Level Read Mapping

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.