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Cluster: HRGMv2_2371_CGC2

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_142 171584 172594 + GT2
CAZyme HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_143 172597 173562 + GT2
CAZyme HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_144 173559 174587 + GT2
CAZyme HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_145 174651 175436 - GT23
CAZyme HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_146 175605 176855 + GT4
CAZyme HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_147 176859 177605 + GT2
TC HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_148 177615 179021 + 2.A.50.2.1
pfam HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_149 179050 180405 + ALGX
STP HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_150 180504 181358 + Fer4
TC HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_151 181440 182915 - 2.A.25.1.9
STP HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_152 182945 184126 - Aminotran_1_2
CAZyme HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_153 184338 185036 + GT2
pfam HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_154 185040 185471 + DUF2304
pfam HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_155 185610 186464 + Epimerase | Polysacc_synt_2 | RmlD_sub_bind | GDP_Man_Dehyd
CAZyme HRGMv2_2371_1 HRGMv2_2371_1_156 186598 187554 + GT2
Gene ID: HRGMv2_2371_1_142
Type: CAZyme
Location: 171584 - 172594 (+)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_143
Type: CAZyme
Location: 172597 - 173562 (+)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_144
Type: CAZyme
Location: 173559 - 174587 (+)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_145
Type: CAZyme
Location: 174651 - 175436 (-)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_146
Type: CAZyme
Location: 175605 - 176855 (+)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_147
Type: CAZyme
Location: 176859 - 177605 (+)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_148
Type: TC
Location: 177615 - 179021 (+)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_149
Type: pfam
Location: 179050 - 180405 (+)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_150
Type: STP
Location: 180504 - 181358 (+)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_151
Type: TC
Location: 181440 - 182915 (-)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_152
Type: STP
Location: 182945 - 184126 (-)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_153
Type: CAZyme
Location: 184338 - 185036 (+)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_154
Type: pfam
Location: 185040 - 185471 (+)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_155
Type: pfam
Location: 185610 - 186464 (+)
Gene ID: HRGMv2_2371_1_156
Type: CAZyme
Location: 186598 - 187554 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_2371_1_144 vegetarian > vegan 1.20789 0.00442
HRGMv2_2371_1_146 vegetarian > omnivore 1.22177 0.00694
HRGMv2_2371_1_152 vegetarian > omnivore 1.29313 0.00694

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