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Cluster: HRGMv2_2105_CGC8

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_658 711895 712890 - 1.A.33.1.5
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_659 713053 713856 - 3.A.1.121.4
sulfatase HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_660 714106 715287 - S1_2
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_661 715694 716797 + 8.A.59.4.1
pfam HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_662 716950 717201 - SpoIIID
TF HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_663 717310 717744 - MarR
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_664 717946 719802 - 3.A.1.135.5
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_665 719802 721529 - 3.A.1.135.5
STP HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_666 721599 722945 - AAA
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_667 723258 724550 - 2.A.1.24.4
pfam HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_668 724592 725419 - Zn_dep_PLPC
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_669 725592 726953 - 2.A.66.1.33
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_670 727000 728847 - 2.A.16.2.2
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_671 728844 730535 - 3.A.1.1.9
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_672 730577 731425 - 3.A.1.1.27
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_673 731422 732753 - 3.A.1.1.27
pfam HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_674 732787 734049 - SBP_bac_8
pfam HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_675 734225 734581 - PqqD
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_676 734562 736463 - 2.A.67.4.2
pfam HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_677 736593 737444 - QRPTase_C | QRPTase_N
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_678 737410 738765 - 3.D.10.1.4
pfam HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_679 738785 739693 - NadA
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_680 739812 741623 - 9.B.33.1.1
TF HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_681 741625 743160 - HTH_AraC
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_682 743336 745489 + 9.B.74.1.1
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_683 745520 746020 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_684 746017 747783 + 9.B.74.1.1
CAZyme HRGMv2_2105_1 HRGMv2_2105_1_685 748017 750320 - GT35
Gene ID: HRGMv2_2105_1_658
Type: TC
Location: 711895 - 712890 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_659
Type: TC
Location: 713053 - 713856 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_660
Type: sulfatase
Location: 714106 - 715287 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_661
Type: TC
Location: 715694 - 716797 (+)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_662
Type: pfam
Location: 716950 - 717201 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_663
Type: TF
Location: 717310 - 717744 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_664
Type: TC
Location: 717946 - 719802 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_665
Type: TC
Location: 719802 - 721529 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_666
Type: STP
Location: 721599 - 722945 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_667
Type: TC
Location: 723258 - 724550 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_668
Type: pfam
Location: 724592 - 725419 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_669
Type: TC
Location: 725592 - 726953 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_670
Type: TC
Location: 727000 - 728847 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_671
Type: TC
Location: 728844 - 730535 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_672
Type: TC
Location: 730577 - 731425 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_673
Type: TC
Location: 731422 - 732753 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_674
Type: pfam
Location: 732787 - 734049 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_675
Type: pfam
Location: 734225 - 734581 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_676
Type: TC
Location: 734562 - 736463 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_677
Type: pfam
Location: 736593 - 737444 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_678
Type: TC
Location: 737410 - 738765 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_679
Type: pfam
Location: 738785 - 739693 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_680
Type: TC
Location: 739812 - 741623 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_681
Type: TF
Location: 741625 - 743160 (-)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_682
Type: TC
Location: 743336 - 745489 (+)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_683
Type:
Location: 745520 - 746020 (+)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_684
Type: TC
Location: 746017 - 747783 (+)
Gene ID: HRGMv2_2105_1_685
Type: CAZyme
Location: 748017 - 750320 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_2105_1_663 vegetarian > vegan 2.06119 0.01276
HRGMv2_2105_1_671 vegetarian > vegan 1.09881 0.01276
HRGMv2_2105_1_673 vegetarian > vegan 1.31805 0.01276
HRGMv2_2105_1_674 vegetarian > vegan 1.11726 0.01276
HRGMv2_2105_1_684 vegetarian > vegan 1.26989 0.01276

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