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Cluster: HRGMv2_2041_CGC18

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_61 69617 71014 + 2.A.35.2.1
pfam HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_62 71107 71508 - ATP-synt_DE | ATP-synt_DE_N
TC HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_63 71523 72923 - 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_64 72959 73825 - 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_65 73844 75373 - 3.A.2.1.5
pfam HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_66 75383 75922 - OSCP
pfam HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_67 75919 76422 - ATP-synt_B
TC HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_68 76460 76738 - 3.A.2.1.2
TC HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_69 76789 77550 - 3.A.2.1.5
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_70 77717 78139 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_71 78244 78609 - ATPase_gene1
CAZyme HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_72 78796 81393 - CBM67 | GH78
STP HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_73 81806 82387 - Nitroreductase
pfam HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_74 82832 83908 + NMO
TC HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_75 84033 85406 + 2.A.22.5.3
TC HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_76 85498 86541 - 3.A.1.10.3
TC HRGMv2_2041_4 HRGMv2_2041_4_77 86552 87256 - 3.A.1.8.1
Gene ID: HRGMv2_2041_4_61
Type: TC
Location: 69617 - 71014 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_62
Type: pfam
Location: 71107 - 71508 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_63
Type: TC
Location: 71523 - 72923 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_64
Type: TC
Location: 72959 - 73825 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_65
Type: TC
Location: 73844 - 75373 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_66
Type: pfam
Location: 75383 - 75922 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_67
Type: pfam
Location: 75919 - 76422 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_68
Type: TC
Location: 76460 - 76738 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_69
Type: TC
Location: 76789 - 77550 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_70
Type:
Location: 77717 - 78139 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_71
Type: pfam
Location: 78244 - 78609 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_72
Type: CAZyme
Location: 78796 - 81393 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_73
Type: STP
Location: 81806 - 82387 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_74
Type: pfam
Location: 82832 - 83908 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_75
Type: TC
Location: 84033 - 85406 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_76
Type: TC
Location: 85498 - 86541 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_4_77
Type: TC
Location: 86552 - 87256 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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