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Cluster: HRGMv2_2041_CGC11

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2041_2 HRGMv2_2041_2_186 221641 223854 + 3.A.1.5.25
TC HRGMv2_2041_2 HRGMv2_2041_2_187 223974 225545 + 3.A.1.5.32
TC HRGMv2_2041_2 HRGMv2_2041_2_188 225552 226520 + 3.A.1.5.19
TC HRGMv2_2041_2 HRGMv2_2041_2_189 226534 228282 + 3.A.1.5.19
TC HRGMv2_2041_2 HRGMv2_2041_2_190 228295 229599 + 3.A.1.5.19
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2041_2 HRGMv2_2041_2_191 229941 231176 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
CAZyme HRGMv2_2041_2 HRGMv2_2041_2_192 231451 234183 + CBM48 | GH13_9
TC HRGMv2_2041_2 HRGMv2_2041_2_193 234187 235059 + 1.A.23.2.1
Gene ID: HRGMv2_2041_2_186
Type: TC
Location: 221641 - 223854 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_2_187
Type: TC
Location: 223974 - 225545 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_2_188
Type: TC
Location: 225552 - 226520 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_2_189
Type: TC
Location: 226534 - 228282 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_2_190
Type: TC
Location: 228295 - 229599 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_2_191
Type:
Location: 229941 - 231176 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_2_192
Type: CAZyme
Location: 231451 - 234183 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_2_193
Type: TC
Location: 234187 - 235059 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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