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Cluster: HRGMv2_2041_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2041_1 HRGMv2_2041_1_52 60585 61391 + 3.A.1.3.15
TC HRGMv2_2041_1 HRGMv2_2041_1_53 61486 62175 + 3.A.1.3.15
TC HRGMv2_2041_1 HRGMv2_2041_1_54 62165 62908 + 3.A.1.3.25
peptidase HRGMv2_2041_1 HRGMv2_2041_1_55 62959 64899 - M24.UPB
CAZyme HRGMv2_2041_1 HRGMv2_2041_1_56 65036 67765 + GH2
TF HRGMv2_2041_1 HRGMv2_2041_1_57 67820 68701 - HTH_AraC | HTH_AraC
TC HRGMv2_2041_1 HRGMv2_2041_1_58 68874 70184 + 2.A.66.1.33
pfam HRGMv2_2041_1 HRGMv2_2041_1_59 70276 71760 - UPF0004 | TRAM | Radical_SAM
TC HRGMv2_2041_1 HRGMv2_2041_1_60 71866 72966 - 2.A.45.2.6
pfam HRGMv2_2041_1 HRGMv2_2041_1_61 73582 74082 + DctQ
TC HRGMv2_2041_1 HRGMv2_2041_1_62 74079 77453 + 2.A.56.1.1
Gene ID: HRGMv2_2041_1_52
Type: TC
Location: 60585 - 61391 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_1_53
Type: TC
Location: 61486 - 62175 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_1_54
Type: TC
Location: 62165 - 62908 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_1_55
Type: peptidase
Location: 62959 - 64899 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_1_56
Type: CAZyme
Location: 65036 - 67765 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_1_57
Type: TF
Location: 67820 - 68701 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_1_58
Type: TC
Location: 68874 - 70184 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_1_59
Type: pfam
Location: 70276 - 71760 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_1_60
Type: TC
Location: 71866 - 72966 (-)
Gene ID: HRGMv2_2041_1_61
Type: pfam
Location: 73582 - 74082 (+)
Gene ID: HRGMv2_2041_1_62
Type: TC
Location: 74079 - 77453 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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