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Cluster: HRGMv2_1901_CGC38

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1901_17 HRGMv2_1901_17_35 29843 30526 + 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_1901_17 HRGMv2_1901_17_36 30573 30815 + 3.A.2.1.5
pfam HRGMv2_1901_17 HRGMv2_1901_17_37 30855 31358 + ATP-synt_B
pfam HRGMv2_1901_17 HRGMv2_1901_17_38 31358 31888 + OSCP
TC HRGMv2_1901_17 HRGMv2_1901_17_39 31898 33421 + 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_1901_17 HRGMv2_1901_17_40 33426 34277 + 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_1901_17 HRGMv2_1901_17_41 34293 35699 + 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_1901_17 HRGMv2_1901_17_42 35686 36084 + 3.A.2.1.5
pfam HRGMv2_1901_17 HRGMv2_1901_17_43 36480 37205 + Amidase_3
CAZyme HRGMv2_1901_17 HRGMv2_1901_17_44 37376 38815 + CE4
Gene ID: HRGMv2_1901_17_35
Type: TC
Location: 29843 - 30526 (+)
Gene ID: HRGMv2_1901_17_36
Type: TC
Location: 30573 - 30815 (+)
Gene ID: HRGMv2_1901_17_37
Type: pfam
Location: 30855 - 31358 (+)
Gene ID: HRGMv2_1901_17_38
Type: pfam
Location: 31358 - 31888 (+)
Gene ID: HRGMv2_1901_17_39
Type: TC
Location: 31898 - 33421 (+)
Gene ID: HRGMv2_1901_17_40
Type: TC
Location: 33426 - 34277 (+)
Gene ID: HRGMv2_1901_17_41
Type: TC
Location: 34293 - 35699 (+)
Gene ID: HRGMv2_1901_17_42
Type: TC
Location: 35686 - 36084 (+)
Gene ID: HRGMv2_1901_17_43
Type: pfam
Location: 36480 - 37205 (+)
Gene ID: HRGMv2_1901_17_44
Type: CAZyme
Location: 37376 - 38815 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1901_17_36 vegan > omnivore 1.45404 0.00574

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