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Cluster: HRGMv2_1726_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1726_1 HRGMv2_1726_1_2 1282 2064 - GT2
CAZyme HRGMv2_1726_1 HRGMv2_1726_1_3 2061 3170 - GT4
pfam HRGMv2_1726_1 HRGMv2_1726_1_4 3386 5662 + PHO4
pfam HRGMv2_1726_1 HRGMv2_1726_1_5 6649 7332 - PhoU | PhoU
TC HRGMv2_1726_1 HRGMv2_1726_1_6 7332 8087 - 3.A.1.7.2
STP HRGMv2_1726_1 HRGMv2_1726_1_7 8090 9892 - HATPase_c | HisKA | PAS
TF HRGMv2_1726_1 HRGMv2_1726_1_8 9894 10568 - Trans_reg_C
TC HRGMv2_1726_1 HRGMv2_1726_1_9 10789 11604 + 3.A.1.7.5
TC HRGMv2_1726_1 HRGMv2_1726_1_10 11792 12679 + 3.A.1.7.1
TC HRGMv2_1726_1 HRGMv2_1726_1_11 12691 13566 + 3.A.1.7.5
Gene ID: HRGMv2_1726_1_2
Type: CAZyme
Location: 1282 - 2064 (-)
Gene ID: HRGMv2_1726_1_3
Type: CAZyme
Location: 2061 - 3170 (-)
Gene ID: HRGMv2_1726_1_4
Type: pfam
Location: 3386 - 5662 (+)
Gene ID: HRGMv2_1726_1_5
Type: pfam
Location: 6649 - 7332 (-)
Gene ID: HRGMv2_1726_1_6
Type: TC
Location: 7332 - 8087 (-)
Gene ID: HRGMv2_1726_1_7
Type: STP
Location: 8090 - 9892 (-)
Gene ID: HRGMv2_1726_1_8
Type: TF
Location: 9894 - 10568 (-)
Gene ID: HRGMv2_1726_1_9
Type: TC
Location: 10789 - 11604 (+)
Gene ID: HRGMv2_1726_1_10
Type: TC
Location: 11792 - 12679 (+)
Gene ID: HRGMv2_1726_1_11
Type: TC
Location: 12691 - 13566 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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