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Cluster: HRGMv2_1681_CGC8

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_85 100735 101565 - 4.A.6.1.9
TC HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_86 101565 102374 - 4.A.6.1.9
TC HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_87 102456 102932 - 4.A.6.1.9
TC HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_88 103047 103487 - 4.A.6.1.10
TF HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_89 103744 104508 + HTH_DeoR
TF HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_90 104505 105284 + HTH_DeoR
CAZyme HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_91 105386 106549 - CE9
STP HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_92 106796 107962 - SIS
TF HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_93 108218 108949 - GntR
TC HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_94 109119 110216 - 4.A.6.1.4
TC HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_95 110206 111003 - 4.A.6.1.4
TC HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_96 111103 111585 - 4.A.6.1.4
pfam HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_97 111685 111969 - YajC
TC HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_98 111969 112412 - 4.A.6.1.8
pfam HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_99 112870 113481 + Flavodoxin_5
peptidase HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_100 113572 115011 + M20.UPD
TC HRGMv2_1681_4 HRGMv2_1681_4_101 115142 115957 - 2.A.5.5.2
Gene ID: HRGMv2_1681_4_85
Type: TC
Location: 100735 - 101565 (-)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_86
Type: TC
Location: 101565 - 102374 (-)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_87
Type: TC
Location: 102456 - 102932 (-)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_88
Type: TC
Location: 103047 - 103487 (-)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_89
Type: TF
Location: 103744 - 104508 (+)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_90
Type: TF
Location: 104505 - 105284 (+)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_91
Type: CAZyme
Location: 105386 - 106549 (-)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_92
Type: STP
Location: 106796 - 107962 (-)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_93
Type: TF
Location: 108218 - 108949 (-)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_94
Type: TC
Location: 109119 - 110216 (-)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_95
Type: TC
Location: 110206 - 111003 (-)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_96
Type: TC
Location: 111103 - 111585 (-)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_97
Type: pfam
Location: 111685 - 111969 (-)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_98
Type: TC
Location: 111969 - 112412 (-)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_99
Type: pfam
Location: 112870 - 113481 (+)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_100
Type: peptidase
Location: 113572 - 115011 (+)
Gene ID: HRGMv2_1681_4_101
Type: TC
Location: 115142 - 115957 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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