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Cluster: HRGMv2_1675_CGC29

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1675_31 HRGMv2_1675_31_2 894 2639 - 3.A.18.1.1
pfam HRGMv2_1675_31 HRGMv2_1675_31_3 2848 3699 - F_bP_aldolase
STP HRGMv2_1675_31 HRGMv2_1675_31_4 3783 4718 - PfkB
TC HRGMv2_1675_31 HRGMv2_1675_31_5 5113 5550 + 4.A.6.2.1
TC HRGMv2_1675_31 HRGMv2_1675_31_6 5608 6090 + 4.A.6.1.4
TC HRGMv2_1675_31 HRGMv2_1675_31_7 6212 7015 + 4.A.6.1.4
TC HRGMv2_1675_31 HRGMv2_1675_31_8 7005 8105 + 4.A.6.1.4
TF HRGMv2_1675_31 HRGMv2_1675_31_9 8264 8992 + GntR
STP HRGMv2_1675_31 HRGMv2_1675_31_10 9018 10193 + SIS
CAZyme HRGMv2_1675_31 HRGMv2_1675_31_11 10234 11403 + CE9
Gene ID: HRGMv2_1675_31_2
Type: TC
Location: 894 - 2639 (-)
Gene ID: HRGMv2_1675_31_3
Type: pfam
Location: 2848 - 3699 (-)
Gene ID: HRGMv2_1675_31_4
Type: STP
Location: 3783 - 4718 (-)
Gene ID: HRGMv2_1675_31_5
Type: TC
Location: 5113 - 5550 (+)
Gene ID: HRGMv2_1675_31_6
Type: TC
Location: 5608 - 6090 (+)
Gene ID: HRGMv2_1675_31_7
Type: TC
Location: 6212 - 7015 (+)
Gene ID: HRGMv2_1675_31_8
Type: TC
Location: 7005 - 8105 (+)
Gene ID: HRGMv2_1675_31_9
Type: TF
Location: 8264 - 8992 (+)
Gene ID: HRGMv2_1675_31_10
Type: STP
Location: 9018 - 10193 (+)
Gene ID: HRGMv2_1675_31_11
Type: CAZyme
Location: 10234 - 11403 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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