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Cluster: HRGMv2_4335_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_4335_1 HRGMv2_4335_1_108 99434 100621 - 2.A.1.2.65
TF HRGMv2_4335_1 HRGMv2_4335_1_109 100749 101147 + DUF24
pfam HRGMv2_4335_1 HRGMv2_4335_1_110 101151 101522 + DUF1304
CAZyme HRGMv2_4335_1 HRGMv2_4335_1_111 101561 103120 - AA1
TC HRGMv2_4335_1 HRGMv2_4335_1_112 103321 104064 + 9.B.120.1.1
pfam HRGMv2_4335_1 HRGMv2_4335_1_113 104102 105103 - Dus
TC HRGMv2_4335_1 HRGMv2_4335_1_114 105297 106154 + 2.A.7.5.5
TC HRGMv2_4335_1 HRGMv2_4335_1_115 106423 106731 + 4.A.3.2.3
TC HRGMv2_4335_1 HRGMv2_4335_1_116 106735 107976 + 4.A.3.2.3
TC HRGMv2_4335_1 HRGMv2_4335_1_117 107980 108327 + 4.A.3.2.2
CAZyme HRGMv2_4335_1 HRGMv2_4335_1_118 108340 109785 + GH1
TC HRGMv2_4335_1 HRGMv2_4335_1_119 109900 111264 + 2.A.39.3.14
Gene ID: HRGMv2_4335_1_108
Type: TC
Location: 99434 - 100621 (-)
Gene ID: HRGMv2_4335_1_109
Type: TF
Location: 100749 - 101147 (+)
Gene ID: HRGMv2_4335_1_110
Type: pfam
Location: 101151 - 101522 (+)
Gene ID: HRGMv2_4335_1_111
Type: CAZyme
Location: 101561 - 103120 (-)
Gene ID: HRGMv2_4335_1_112
Type: TC
Location: 103321 - 104064 (+)
Gene ID: HRGMv2_4335_1_113
Type: pfam
Location: 104102 - 105103 (-)
Gene ID: HRGMv2_4335_1_114
Type: TC
Location: 105297 - 106154 (+)
Gene ID: HRGMv2_4335_1_115
Type: TC
Location: 106423 - 106731 (+)
Gene ID: HRGMv2_4335_1_116
Type: TC
Location: 106735 - 107976 (+)
Gene ID: HRGMv2_4335_1_117
Type: TC
Location: 107980 - 108327 (+)
Gene ID: HRGMv2_4335_1_118
Type: CAZyme
Location: 108340 - 109785 (+)
Gene ID: HRGMv2_4335_1_119
Type: TC
Location: 109900 - 111264 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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