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Cluster: HRGMv2_4312_CGC19

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_4312_41 HRGMv2_4312_41_7 5694 7442 - GH2
TC HRGMv2_4312_41 HRGMv2_4312_41_8 7613 8029 - 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_4312_41 HRGMv2_4312_41_9 8036 9436 - 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_4312_41 HRGMv2_4312_41_10 9448 10341 - 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_4312_41 HRGMv2_4312_41_11 10354 11859 - 3.A.2.1.5
pfam HRGMv2_4312_41 HRGMv2_4312_41_12 11865 12398 - OSCP
pfam HRGMv2_4312_41 HRGMv2_4312_41_13 12379 12879 - ATP-synt_B
TC HRGMv2_4312_41 HRGMv2_4312_41_14 12934 13161 - 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_4312_41 HRGMv2_4312_41_15 13186 13758 - 3.A.2.1.5
pfam HRGMv2_4312_41 HRGMv2_4312_41_16 14512 15117 - Acetyltransf_1 | Acetyltransf_4 | Acetyltransf_7
pfam HRGMv2_4312_41 HRGMv2_4312_41_17 15144 15941 - ABC2_membrane_2
TC HRGMv2_4312_41 HRGMv2_4312_41_18 15938 16822 - 3.A.1.126.1
Gene ID: HRGMv2_4312_41_7
Type: CAZyme
Location: 5694 - 7442 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_41_8
Type: TC
Location: 7613 - 8029 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_41_9
Type: TC
Location: 8036 - 9436 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_41_10
Type: TC
Location: 9448 - 10341 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_41_11
Type: TC
Location: 10354 - 11859 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_41_12
Type: pfam
Location: 11865 - 12398 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_41_13
Type: pfam
Location: 12379 - 12879 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_41_14
Type: TC
Location: 12934 - 13161 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_41_15
Type: TC
Location: 13186 - 13758 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_41_16
Type: pfam
Location: 14512 - 15117 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_41_17
Type: pfam
Location: 15144 - 15941 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_41_18
Type: TC
Location: 15938 - 16822 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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