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Cluster: HRGMv2_4312_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_146 141423 142121 - 9.B.27.1.1
sulfatase HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_147 142194 147893 - S1_32
CAZyme HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_148 148111 149292 - GT2
STP HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_149 149294 150301 - Rhodanese | Rhodanese
pfam HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_150 150282 151430 - Acyl_transf_3
TC HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_151 151444 152457 - 3.A.1.11.7
TC HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_152 152454 153263 - 3.A.1.1.47
pfam HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_153 153260 154132 - BPD_transp_1
TC HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_154 154132 155376 - 3.A.1.19.4
pfam HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_155 155395 156396 - Choline_kinase | APH
CAZyme HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_156 156413 157750 - GT2
pfam HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_157 157751 158179 - C_GCAxxG_C_C
TC HRGMv2_4312_1 HRGMv2_4312_1_158 158160 158882 - 9.B.27.1.2
Gene ID: HRGMv2_4312_1_146
Type: TC
Location: 141423 - 142121 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_1_147
Type: sulfatase
Location: 142194 - 147893 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_1_148
Type: CAZyme
Location: 148111 - 149292 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_1_149
Type: STP
Location: 149294 - 150301 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_1_150
Type: pfam
Location: 150282 - 151430 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_1_151
Type: TC
Location: 151444 - 152457 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_1_152
Type: TC
Location: 152454 - 153263 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_1_153
Type: pfam
Location: 153260 - 154132 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_1_154
Type: TC
Location: 154132 - 155376 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_1_155
Type: pfam
Location: 155395 - 156396 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_1_156
Type: CAZyme
Location: 156413 - 157750 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_1_157
Type: pfam
Location: 157751 - 158179 (-)
Gene ID: HRGMv2_4312_1_158
Type: TC
Location: 158160 - 158882 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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