dbCAN Logo

Cluster: HRGMv2_4241_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_4241_1 HRGMv2_4241_1_1 2 619 + 9.B.10.1.1
TC HRGMv2_4241_1 HRGMv2_4241_1_2 857 2668 + 9.B.18.2.1
pfam HRGMv2_4241_1 HRGMv2_4241_1_3 2738 2926 + DUF3990
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_4241_1 HRGMv2_4241_1_4 2904 3347 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_4241_1 HRGMv2_4241_1_5 3407 4780 + 9.B.18.1.3
pfam HRGMv2_4241_1 HRGMv2_4241_1_6 4797 5897 + GLF | NAD_binding_8
CAZyme HRGMv2_4241_1 HRGMv2_4241_1_7 5908 6966 + GT2
CAZyme HRGMv2_4241_1 HRGMv2_4241_1_8 6969 8042 + GT2
CAZyme HRGMv2_4241_1 HRGMv2_4241_1_9 8052 9047 + GT2
CAZyme HRGMv2_4241_1 HRGMv2_4241_1_10 9060 10115 + GT2
pfam HRGMv2_4241_1 HRGMv2_4241_1_11 10112 11536 + Wzy_C
TC HRGMv2_4241_1 HRGMv2_4241_1_12 11526 12830 + 2.A.66.2.9
Gene ID: HRGMv2_4241_1_1
Type: TC
Location: 2 - 619 (+)
Gene ID: HRGMv2_4241_1_2
Type: TC
Location: 857 - 2668 (+)
Gene ID: HRGMv2_4241_1_3
Type: pfam
Location: 2738 - 2926 (+)
Gene ID: HRGMv2_4241_1_4
Type:
Location: 2904 - 3347 (+)
Gene ID: HRGMv2_4241_1_5
Type: TC
Location: 3407 - 4780 (+)
Gene ID: HRGMv2_4241_1_6
Type: pfam
Location: 4797 - 5897 (+)
Gene ID: HRGMv2_4241_1_7
Type: CAZyme
Location: 5908 - 6966 (+)
Gene ID: HRGMv2_4241_1_8
Type: CAZyme
Location: 6969 - 8042 (+)
Gene ID: HRGMv2_4241_1_9
Type: CAZyme
Location: 8052 - 9047 (+)
Gene ID: HRGMv2_4241_1_10
Type: CAZyme
Location: 9060 - 10115 (+)
Gene ID: HRGMv2_4241_1_11
Type: pfam
Location: 10112 - 11536 (+)
Gene ID: HRGMv2_4241_1_12
Type: TC
Location: 11526 - 12830 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List