dbCAN Logo

Cluster: HRGMv2_4010_CGC24

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_4010_31 HRGMv2_4010_31_14 11670 14171 + GH95
pfam HRGMv2_4010_31 HRGMv2_4010_31_15 14211 14432 - DUF2795
TC HRGMv2_4010_31 HRGMv2_4010_31_16 14550 15419 - 2.A.4.7.2
TC HRGMv2_4010_31 HRGMv2_4010_31_17 15443 17230 - 2.A.49.6.4
pfam HRGMv2_4010_31 HRGMv2_4010_31_18 17243 18370 - DUF4831
pfam HRGMv2_4010_31 HRGMv2_4010_31_19 18367 19893 - Carb_kinase | YjeF_N
TC HRGMv2_4010_31 HRGMv2_4010_31_20 19989 21548 + 2.A.17.1.7
TC HRGMv2_4010_31 HRGMv2_4010_31_21 21634 23322 + 2.A.17.1.1
Gene ID: HRGMv2_4010_31_14
Type: CAZyme
Location: 11670 - 14171 (+)
Gene ID: HRGMv2_4010_31_15
Type: pfam
Location: 14211 - 14432 (-)
Gene ID: HRGMv2_4010_31_16
Type: TC
Location: 14550 - 15419 (-)
Gene ID: HRGMv2_4010_31_17
Type: TC
Location: 15443 - 17230 (-)
Gene ID: HRGMv2_4010_31_18
Type: pfam
Location: 17243 - 18370 (-)
Gene ID: HRGMv2_4010_31_19
Type: pfam
Location: 18367 - 19893 (-)
Gene ID: HRGMv2_4010_31_20
Type: TC
Location: 19989 - 21548 (+)
Gene ID: HRGMv2_4010_31_21
Type: TC
Location: 21634 - 23322 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List