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Cluster: HRGMv2_3611_CGC8

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_64 73992 75914 + 3.A.2.2.2
TC HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_65 75914 76381 + 3.A.2.2.2
pfam HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_66 76397 76960 + vATP-synt_E
pfam HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_67 76957 77991 + vATP-synt_AC39
TC HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_68 77984 78295 + 3.A.2.2.2
TC HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_69 78307 80064 + 3.A.2.2.2
TC HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_70 80069 81436 + 3.A.2.2.2
TC HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_71 81440 82078 + 3.A.2.2.2
TC HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_72 82400 83998 + 2.A.35.2.1
TC HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_73 84070 85020 + 1.A.35.3.2
TC HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_74 85090 86442 + 9.A.40.2.2
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_75 86738 87610 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TF HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_76 88113 89189 + LacI
CAZyme HRGMv2_3611_4 HRGMv2_3611_4_77 89192 90661 + GH77
Gene ID: HRGMv2_3611_4_64
Type: TC
Location: 73992 - 75914 (+)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_65
Type: TC
Location: 75914 - 76381 (+)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_66
Type: pfam
Location: 76397 - 76960 (+)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_67
Type: pfam
Location: 76957 - 77991 (+)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_68
Type: TC
Location: 77984 - 78295 (+)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_69
Type: TC
Location: 78307 - 80064 (+)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_70
Type: TC
Location: 80069 - 81436 (+)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_71
Type: TC
Location: 81440 - 82078 (+)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_72
Type: TC
Location: 82400 - 83998 (+)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_73
Type: TC
Location: 84070 - 85020 (+)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_74
Type: TC
Location: 85090 - 86442 (+)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_75
Type:
Location: 86738 - 87610 (-)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_76
Type: TF
Location: 88113 - 89189 (+)
Gene ID: HRGMv2_3611_4_77
Type: CAZyme
Location: 89192 - 90661 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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