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Cluster: HRGMv2_3241_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3241_1 HRGMv2_3241_1_170 197894 199156 - 2.A.45.2.2
TC HRGMv2_3241_1 HRGMv2_3241_1_171 199431 200339 + 2.A.7.7.2
TF HRGMv2_3241_1 HRGMv2_3241_1_172 200359 200688 - HTH_3
pfam HRGMv2_3241_1 HRGMv2_3241_1_173 201110 204781 + MucBP
TC HRGMv2_3241_1 HRGMv2_3241_1_174 205192 205995 + 9.B.27.1.2
TC HRGMv2_3241_1 HRGMv2_3241_1_175 206014 206778 + 9.B.27.1.1
pfam HRGMv2_3241_1 HRGMv2_3241_1_176 206794 207795 + CCG | CCG
CAZyme HRGMv2_3241_1 HRGMv2_3241_1_177 207795 209852 + GT2
CAZyme HRGMv2_3241_1 HRGMv2_3241_1_178 209852 211954 + GT4
pfam HRGMv2_3241_1 HRGMv2_3241_1_179 211951 213255 + Wzy_C
TC HRGMv2_3241_1 HRGMv2_3241_1_180 213252 214856 + 2.A.50.2.1
Gene ID: HRGMv2_3241_1_170
Type: TC
Location: 197894 - 199156 (-)
Gene ID: HRGMv2_3241_1_171
Type: TC
Location: 199431 - 200339 (+)
Gene ID: HRGMv2_3241_1_172
Type: TF
Location: 200359 - 200688 (-)
Gene ID: HRGMv2_3241_1_173
Type: pfam
Location: 201110 - 204781 (+)
Gene ID: HRGMv2_3241_1_174
Type: TC
Location: 205192 - 205995 (+)
Gene ID: HRGMv2_3241_1_175
Type: TC
Location: 206014 - 206778 (+)
Gene ID: HRGMv2_3241_1_176
Type: pfam
Location: 206794 - 207795 (+)
Gene ID: HRGMv2_3241_1_177
Type: CAZyme
Location: 207795 - 209852 (+)
Gene ID: HRGMv2_3241_1_178
Type: CAZyme
Location: 209852 - 211954 (+)
Gene ID: HRGMv2_3241_1_179
Type: pfam
Location: 211951 - 213255 (+)
Gene ID: HRGMv2_3241_1_180
Type: TC
Location: 213252 - 214856 (+)

Taxonomic Lineage

Domain
Bacteria
→
Phylum
Bacillota_A
→
Class
Clostridia
→
Order
Peptostreptococcales
→
Family
Anaerovoracaceae
→
Genus
Baileyella
→

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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