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Cluster: HRGMv2_3235_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3235_1 HRGMv2_3235_1_44 55586 56905 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3235_1 HRGMv2_3235_1_45 56905 57894 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3235_1 HRGMv2_3235_1_46 57881 58432 + 3.D.6.1.3
TC HRGMv2_3235_1 HRGMv2_3235_1_47 58432 59118 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3235_1 HRGMv2_3235_1_48 59121 59714 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3235_1 HRGMv2_3235_1_49 59728 60594 + 3.D.6.1.3
TC HRGMv2_3235_1 HRGMv2_3235_1_50 60969 61466 - 2.A.87.3.2
pfam HRGMv2_3235_1 HRGMv2_3235_1_51 61507 61869 - NusG_II
sulfatase HRGMv2_3235_1 HRGMv2_3235_1_52 61891 62961 + S1_16
CAZyme HRGMv2_3235_1 HRGMv2_3235_1_53 63158 64012 + GT2
Gene ID: HRGMv2_3235_1_44
Type: TC
Location: 55586 - 56905 (+)
Gene ID: HRGMv2_3235_1_45
Type: TC
Location: 56905 - 57894 (+)
Gene ID: HRGMv2_3235_1_46
Type: TC
Location: 57881 - 58432 (+)
Gene ID: HRGMv2_3235_1_47
Type: TC
Location: 58432 - 59118 (+)
Gene ID: HRGMv2_3235_1_48
Type: TC
Location: 59121 - 59714 (+)
Gene ID: HRGMv2_3235_1_49
Type: TC
Location: 59728 - 60594 (+)
Gene ID: HRGMv2_3235_1_50
Type: TC
Location: 60969 - 61466 (-)
Gene ID: HRGMv2_3235_1_51
Type: pfam
Location: 61507 - 61869 (-)
Gene ID: HRGMv2_3235_1_52
Type: sulfatase
Location: 61891 - 62961 (+)
Gene ID: HRGMv2_3235_1_53
Type: CAZyme
Location: 63158 - 64012 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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