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Cluster: HRGMv2_3192_CGC11

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_3192_14 HRGMv2_3192_14_36 32621 34591 + CBM48 | GH13_9
pfam HRGMv2_3192_14 HRGMv2_3192_14_37 34593 35801 + NTP_transferase | Hexapep_GlmU
pfam HRGMv2_3192_14 HRGMv2_3192_14_38 35798 36913 + NTP_transferase | Hexapep_GlmU
CAZyme HRGMv2_3192_14 HRGMv2_3192_14_39 36981 38414 + GT5
CAZyme HRGMv2_3192_14 HRGMv2_3192_14_40 38628 41069 + GT35
pfam HRGMv2_3192_14 HRGMv2_3192_14_41 41177 41614 + LacAB_rpiB
TC HRGMv2_3192_14 HRGMv2_3192_14_42 41686 42396 - 3.A.1.4.10
TC HRGMv2_3192_14 HRGMv2_3192_14_43 42393 43253 - 3.A.1.4.10
TC HRGMv2_3192_14 HRGMv2_3192_14_44 43246 44346 - 3.A.1.4.8
TC HRGMv2_3192_14 HRGMv2_3192_14_45 44357 45247 - 3.A.1.4.10
TC HRGMv2_3192_14 HRGMv2_3192_14_46 45438 46610 - 3.A.1.4.10
Gene ID: HRGMv2_3192_14_36
Type: CAZyme
Location: 32621 - 34591 (+)
Gene ID: HRGMv2_3192_14_37
Type: pfam
Location: 34593 - 35801 (+)
Gene ID: HRGMv2_3192_14_38
Type: pfam
Location: 35798 - 36913 (+)
Gene ID: HRGMv2_3192_14_39
Type: CAZyme
Location: 36981 - 38414 (+)
Gene ID: HRGMv2_3192_14_40
Type: CAZyme
Location: 38628 - 41069 (+)
Gene ID: HRGMv2_3192_14_41
Type: pfam
Location: 41177 - 41614 (+)
Gene ID: HRGMv2_3192_14_42
Type: TC
Location: 41686 - 42396 (-)
Gene ID: HRGMv2_3192_14_43
Type: TC
Location: 42393 - 43253 (-)
Gene ID: HRGMv2_3192_14_44
Type: TC
Location: 43246 - 44346 (-)
Gene ID: HRGMv2_3192_14_45
Type: TC
Location: 44357 - 45247 (-)
Gene ID: HRGMv2_3192_14_46
Type: TC
Location: 45438 - 46610 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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