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Cluster: HRGMv2_3190_CGC6

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_22 21870 22238 - 9.A.11.1.1
TC HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_23 22252 23256 - 9.A.11.1.1
TC HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_24 23270 23722 - 9.A.11.1.1
pfam HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_25 23872 24519 + TAL_FSA
TC HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_26 25033 25719 + 3.A.1.122.2
pfam HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_27 25784 26902 - DUF348 | 3D | G5
CAZyme HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_28 27497 31147 - CBM6 | CBM6 | CBM6
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_29 31185 31349 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_30 31860 32441 - UDG
TC HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_31 32638 34416 - 3.A.1.106.3
TC HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_32 34409 36154 - 3.A.1.106.3
pfam HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_33 36223 36993 - HGSNAT_cat
pfam HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_34 37265 38098 + Amidohydro_2
TC HRGMv2_3190_12 HRGMv2_3190_12_35 38279 39358 + 3.A.1.132.1
Gene ID: HRGMv2_3190_12_22
Type: TC
Location: 21870 - 22238 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_23
Type: TC
Location: 22252 - 23256 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_24
Type: TC
Location: 23270 - 23722 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_25
Type: pfam
Location: 23872 - 24519 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_26
Type: TC
Location: 25033 - 25719 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_27
Type: pfam
Location: 25784 - 26902 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_28
Type: CAZyme
Location: 27497 - 31147 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_29
Type:
Location: 31185 - 31349 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_30
Type: pfam
Location: 31860 - 32441 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_31
Type: TC
Location: 32638 - 34416 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_32
Type: TC
Location: 34409 - 36154 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_33
Type: pfam
Location: 36223 - 36993 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_34
Type: pfam
Location: 37265 - 38098 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_12_35
Type: TC
Location: 38279 - 39358 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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