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Cluster: HRGMv2_3190_CGC13

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_4 2685 3896 + GT4
TC HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_5 3997 5133 + 9.B.183.1.9
CAZyme HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_6 5258 6517 + GT4
pfam HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_7 6495 7052 + Hexapep | Hexapep_2
CAZyme HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_8 7069 8127 + GT2
TC HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_9 8337 9836 + 8.A.3.3.2
pfam HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_10 9907 10632 + CpsB_CapC
pfam HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_11 10880 11332 + NfeD
TC HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_12 11364 12296 + 8.A.21.2.2
TC HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_13 12791 14365 + 2.A.21.2.6
TC HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_14 14433 15503 - 3.A.1.11.7
TC HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_15 15595 16410 - 3.A.1.11.1
TC HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_16 16407 17219 - 3.A.1.11.8
TC HRGMv2_3190_38 HRGMv2_3190_38_17 17209 18366 - 3.A.1.11.8
Gene ID: HRGMv2_3190_38_4
Type: CAZyme
Location: 2685 - 3896 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_5
Type: TC
Location: 3997 - 5133 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_6
Type: CAZyme
Location: 5258 - 6517 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_7
Type: pfam
Location: 6495 - 7052 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_8
Type: CAZyme
Location: 7069 - 8127 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_9
Type: TC
Location: 8337 - 9836 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_10
Type: pfam
Location: 9907 - 10632 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_11
Type: pfam
Location: 10880 - 11332 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_12
Type: TC
Location: 11364 - 12296 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_13
Type: TC
Location: 12791 - 14365 (+)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_14
Type: TC
Location: 14433 - 15503 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_15
Type: TC
Location: 15595 - 16410 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_16
Type: TC
Location: 16407 - 17219 (-)
Gene ID: HRGMv2_3190_38_17
Type: TC
Location: 17209 - 18366 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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