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Cluster: HRGMv2_3189_CGC10

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_3189_2 HRGMv2_3189_2_130 133730 134791 - GH18
STP HRGMv2_3189_2 HRGMv2_3189_2_131 134812 136035 - HD
pfam HRGMv2_3189_2 HRGMv2_3189_2_132 136040 136756 - RadC
TC HRGMv2_3189_2 HRGMv2_3189_2_133 137027 138385 + 2.A.22.5.3
CAZyme HRGMv2_3189_2 HRGMv2_3189_2_134 138826 140289 - GH29
pfam HRGMv2_3189_2 HRGMv2_3189_2_135 140303 142717 - GH123_N
TF HRGMv2_3189_2 HRGMv2_3189_2_136 143029 143865 + HTH_AraC
TC HRGMv2_3189_2 HRGMv2_3189_2_137 144082 145152 + 3.A.1.2.3
TC HRGMv2_3189_2 HRGMv2_3189_2_138 145121 146674 + 3.A.1.2.3
TC HRGMv2_3189_2 HRGMv2_3189_2_139 146686 147753 + 3.A.1.2.3
Gene ID: HRGMv2_3189_2_130
Type: CAZyme
Location: 133730 - 134791 (-)
Gene ID: HRGMv2_3189_2_131
Type: STP
Location: 134812 - 136035 (-)
Gene ID: HRGMv2_3189_2_132
Type: pfam
Location: 136040 - 136756 (-)
Gene ID: HRGMv2_3189_2_133
Type: TC
Location: 137027 - 138385 (+)
Gene ID: HRGMv2_3189_2_134
Type: CAZyme
Location: 138826 - 140289 (-)
Gene ID: HRGMv2_3189_2_135
Type: pfam
Location: 140303 - 142717 (-)
Gene ID: HRGMv2_3189_2_136
Type: TF
Location: 143029 - 143865 (+)
Gene ID: HRGMv2_3189_2_137
Type: TC
Location: 144082 - 145152 (+)
Gene ID: HRGMv2_3189_2_138
Type: TC
Location: 145121 - 146674 (+)
Gene ID: HRGMv2_3189_2_139
Type: TC
Location: 146686 - 147753 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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