dbCAN Logo

Cluster: HRGMv2_3187_CGC18

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_87 98994 100451 - 2.A.25.1.4
peptidase HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_88 100609 102201 - S12.UPW
pfam HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_89 102388 103584 + CHAP
TC HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_90 103618 105519 + 9.B.18.2.1
TC HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_91 105547 106956 + 2.A.38.4.1
STP HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_92 107002 107643 + TrkA_C
pfam HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_93 107650 108423 + KduI
TC HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_94 108564 109352 + 3.A.1.3.3
TC HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_95 109430 110158 + 3.A.1.3.20
TC HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_96 110148 110891 + 3.A.1.3.25
CAZyme HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_97 110939 112279 - CE4
TC HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_98 112550 114460 + 3.D.1.4.2
TC HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_99 114460 115362 + 3.D.1.4.2
TC HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_100 115350 115784 + 3.D.1.4.2
pfam HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_101 115785 116165 + Complex1_30kDa
TC HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_102 116167 117246 + 3.D.1.4.2
TC HRGMv2_3187_9 HRGMv2_3187_9_103 117257 117838 + 3.D.1.4.2
Gene ID: HRGMv2_3187_9_87
Type: TC
Location: 98994 - 100451 (-)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_88
Type: peptidase
Location: 100609 - 102201 (-)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_89
Type: pfam
Location: 102388 - 103584 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_90
Type: TC
Location: 103618 - 105519 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_91
Type: TC
Location: 105547 - 106956 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_92
Type: STP
Location: 107002 - 107643 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_93
Type: pfam
Location: 107650 - 108423 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_94
Type: TC
Location: 108564 - 109352 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_95
Type: TC
Location: 109430 - 110158 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_96
Type: TC
Location: 110148 - 110891 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_97
Type: CAZyme
Location: 110939 - 112279 (-)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_98
Type: TC
Location: 112550 - 114460 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_99
Type: TC
Location: 114460 - 115362 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_100
Type: TC
Location: 115350 - 115784 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_101
Type: pfam
Location: 115785 - 116165 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_102
Type: TC
Location: 116167 - 117246 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_9_103
Type: TC
Location: 117257 - 117838 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List