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Cluster: HRGMv2_3187_CGC10

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3187_6 HRGMv2_3187_6_56 55201 57045 - 3.A.1.135.5
TC HRGMv2_3187_6 HRGMv2_3187_6_57 57045 58796 - 3.A.1.135.5
TF HRGMv2_3187_6 HRGMv2_3187_6_58 58790 59254 - MarR
pfam HRGMv2_3187_6 HRGMv2_3187_6_59 59384 60232 + RrnaAD
TC HRGMv2_3187_6 HRGMv2_3187_6_60 60244 61638 + 2.A.66.1.13
peptidase HRGMv2_3187_6 HRGMv2_3187_6_61 61690 62451 - S09.UPB
CAZyme HRGMv2_3187_6 HRGMv2_3187_6_62 62465 63769 - GH27
Gene ID: HRGMv2_3187_6_56
Type: TC
Location: 55201 - 57045 (-)
Gene ID: HRGMv2_3187_6_57
Type: TC
Location: 57045 - 58796 (-)
Gene ID: HRGMv2_3187_6_58
Type: TF
Location: 58790 - 59254 (-)
Gene ID: HRGMv2_3187_6_59
Type: pfam
Location: 59384 - 60232 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_6_60
Type: TC
Location: 60244 - 61638 (+)
Gene ID: HRGMv2_3187_6_61
Type: peptidase
Location: 61690 - 62451 (-)
Gene ID: HRGMv2_3187_6_62
Type: CAZyme
Location: 62465 - 63769 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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