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Cluster: HRGMv2_3182_CGC2

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_20 20552 21319 + 2.A.79.1.4
TC HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_21 21335 21805 + 2.A.79.1.6
TC HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_22 21884 22558 - 3.A.2.2.2
TC HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_23 22586 23962 - 3.A.2.2.2
TC HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_24 23959 25734 - 3.A.2.2.2
TC HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_25 25853 26170 - 3.A.2.2.2
pfam HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_26 26160 27164 - vATP-synt_AC39
pfam HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_27 27177 27764 - vATP-synt_E
TC HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_28 27781 28275 - 3.A.2.2.2
TC HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_29 28279 30228 - 3.A.2.2.2
pfam HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_30 30219 30536 - V-ATPase_G
pfam HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_31 30728 32179 - Polysacc_synt | Polysacc_synt_3
CAZyme HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_32 32418 34655 + GT4
TC HRGMv2_3182_4 HRGMv2_3182_4_33 34912 35616 + 3.A.1.125.2
Gene ID: HRGMv2_3182_4_20
Type: TC
Location: 20552 - 21319 (+)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_21
Type: TC
Location: 21335 - 21805 (+)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_22
Type: TC
Location: 21884 - 22558 (-)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_23
Type: TC
Location: 22586 - 23962 (-)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_24
Type: TC
Location: 23959 - 25734 (-)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_25
Type: TC
Location: 25853 - 26170 (-)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_26
Type: pfam
Location: 26160 - 27164 (-)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_27
Type: pfam
Location: 27177 - 27764 (-)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_28
Type: TC
Location: 27781 - 28275 (-)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_29
Type: TC
Location: 28279 - 30228 (-)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_30
Type: pfam
Location: 30219 - 30536 (-)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_31
Type: pfam
Location: 30728 - 32179 (-)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_32
Type: CAZyme
Location: 32418 - 34655 (+)
Gene ID: HRGMv2_3182_4_33
Type: TC
Location: 34912 - 35616 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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