dbCAN Logo

Cluster: HRGMv2_3157_CGC3

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_22 20375 22114 - 8.A.59.2.1
STP HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_23 22411 23730 + SBP_bac_1
TC HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_24 23824 24696 + 3.A.1.1.47
TC HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_25 24709 25560 + 3.A.1.1.47
TC HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_26 25576 26679 + 3.A.1.1.24
pfam HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_27 26694 27362 + DUF624
CAZyme HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_28 27375 28742 + GH4
STP HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_29 28744 29676 + PfkB
sulfatase HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_30 29673 30410 + S1_9
CAZyme HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_31 30635 32005 - GH28
TC HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_32 32121 33419 - 2.A.56.1.5
TC HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_33 33436 33930 - 2.A.56.1.5
TC HRGMv2_3157_2 HRGMv2_3157_2_34 33944 34939 - 2.A.56.1.5
Gene ID: HRGMv2_3157_2_22
Type: TC
Location: 20375 - 22114 (-)
Gene ID: HRGMv2_3157_2_23
Type: STP
Location: 22411 - 23730 (+)
Gene ID: HRGMv2_3157_2_24
Type: TC
Location: 23824 - 24696 (+)
Gene ID: HRGMv2_3157_2_25
Type: TC
Location: 24709 - 25560 (+)
Gene ID: HRGMv2_3157_2_26
Type: TC
Location: 25576 - 26679 (+)
Gene ID: HRGMv2_3157_2_27
Type: pfam
Location: 26694 - 27362 (+)
Gene ID: HRGMv2_3157_2_28
Type: CAZyme
Location: 27375 - 28742 (+)
Gene ID: HRGMv2_3157_2_29
Type: STP
Location: 28744 - 29676 (+)
Gene ID: HRGMv2_3157_2_30
Type: sulfatase
Location: 29673 - 30410 (+)
Gene ID: HRGMv2_3157_2_31
Type: CAZyme
Location: 30635 - 32005 (-)
Gene ID: HRGMv2_3157_2_32
Type: TC
Location: 32121 - 33419 (-)
Gene ID: HRGMv2_3157_2_33
Type: TC
Location: 33436 - 33930 (-)
Gene ID: HRGMv2_3157_2_34
Type: TC
Location: 33944 - 34939 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List