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Cluster: HRGMv2_3152_CGC3

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_32 40739 41656 + 3.A.1.1.28
TC HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_33 41669 42553 + 3.A.1.1.34
pfam HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_34 42659 43573 + DHDPS
pfam HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_35 43616 44368 + Glucosamine_iso
CAZyme HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_36 44359 45492 + CE9
TC HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_37 45687 46817 + 3.A.1.1.26
TC HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_38 46865 48022 - 3.A.18.1.1
TF HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_39 48349 48555 + HTH_3
CAZyme HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_40 48652 51078 - GT35
CAZyme HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_41 51088 52932 - GT5
pfam HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_42 53074 54186 - NTP_transferase | Hexapep_GlmU
pfam HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_43 54183 55391 - NTP_transferase | Hexapep_GlmU
CAZyme HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_44 55388 57310 - CBM48 | GH13_9
TC HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_45 57683 58504 + 2.A.102.3.1
pfam HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_46 58516 59220 + Asp_Glu_race
TC HRGMv2_3152_14 HRGMv2_3152_14_47 59404 60630 + 2.A.23.1.5
Gene ID: HRGMv2_3152_14_32
Type: TC
Location: 40739 - 41656 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_33
Type: TC
Location: 41669 - 42553 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_34
Type: pfam
Location: 42659 - 43573 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_35
Type: pfam
Location: 43616 - 44368 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_36
Type: CAZyme
Location: 44359 - 45492 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_37
Type: TC
Location: 45687 - 46817 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_38
Type: TC
Location: 46865 - 48022 (-)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_39
Type: TF
Location: 48349 - 48555 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_40
Type: CAZyme
Location: 48652 - 51078 (-)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_41
Type: CAZyme
Location: 51088 - 52932 (-)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_42
Type: pfam
Location: 53074 - 54186 (-)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_43
Type: pfam
Location: 54183 - 55391 (-)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_44
Type: CAZyme
Location: 55388 - 57310 (-)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_45
Type: TC
Location: 57683 - 58504 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_46
Type: pfam
Location: 58516 - 59220 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_14_47
Type: TC
Location: 59404 - 60630 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_3152_14_33 vegan > omnivore 1.00562 0.01057
HRGMv2_3152_14_34 vegan > omnivore 1.20957 0.01057

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