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Cluster: HRGMv2_3152_CGC13

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3152_112 HRGMv2_3152_112_14 14106 15473 - 2.A.66.1.33
TF HRGMv2_3152_112 HRGMv2_3152_112_15 15857 16858 + LacI
STP HRGMv2_3152_112 HRGMv2_3152_112_16 16908 18194 + SBP_bac_1
TC HRGMv2_3152_112 HRGMv2_3152_112_17 18333 19244 + 3.A.1.1.11
TC HRGMv2_3152_112 HRGMv2_3152_112_18 19263 20111 + 3.A.1.1.36
pfam HRGMv2_3152_112 HRGMv2_3152_112_19 20161 21216 + Amidohydro_2
CAZyme HRGMv2_3152_112 HRGMv2_3152_112_20 21237 22631 + GH4
Gene ID: HRGMv2_3152_112_14
Type: TC
Location: 14106 - 15473 (-)
Gene ID: HRGMv2_3152_112_15
Type: TF
Location: 15857 - 16858 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_112_16
Type: STP
Location: 16908 - 18194 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_112_17
Type: TC
Location: 18333 - 19244 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_112_18
Type: TC
Location: 19263 - 20111 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_112_19
Type: pfam
Location: 20161 - 21216 (+)
Gene ID: HRGMv2_3152_112_20
Type: CAZyme
Location: 21237 - 22631 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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