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Cluster: HRGMv2_3142_CGC4

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_3142_1 HRGMv2_3142_1_99 107200 107973 - CE4
STP HRGMv2_3142_1 HRGMv2_3142_1_100 108124 109056 + PALP
TF HRGMv2_3142_1 HRGMv2_3142_1_101 109072 109500 + Rrf2
CAZyme HRGMv2_3142_1 HRGMv2_3142_1_102 109547 110833 - GH140
TC HRGMv2_3142_1 HRGMv2_3142_1_103 111331 113235 - 3.A.1.135.5
TC HRGMv2_3142_1 HRGMv2_3142_1_104 113237 115009 - 3.A.1.106.8
TC HRGMv2_3142_1 HRGMv2_3142_1_105 115006 116451 - 2.A.66.1.37
TF HRGMv2_3142_1 HRGMv2_3142_1_106 116448 116894 - 0040517
TF HRGMv2_3142_1 HRGMv2_3142_1_107 116970 117866 - HTH_1
TC HRGMv2_3142_1 HRGMv2_3142_1_108 117997 119352 + 2.A.66.1.33
CAZyme HRGMv2_3142_1 HRGMv2_3142_1_109 119842 121656 - GH146
TC HRGMv2_3142_1 HRGMv2_3142_1_110 121751 123838 - 3.A.3.32.3
Gene ID: HRGMv2_3142_1_99
Type: CAZyme
Location: 107200 - 107973 (-)
Gene ID: HRGMv2_3142_1_100
Type: STP
Location: 108124 - 109056 (+)
Gene ID: HRGMv2_3142_1_101
Type: TF
Location: 109072 - 109500 (+)
Gene ID: HRGMv2_3142_1_102
Type: CAZyme
Location: 109547 - 110833 (-)
Gene ID: HRGMv2_3142_1_103
Type: TC
Location: 111331 - 113235 (-)
Gene ID: HRGMv2_3142_1_104
Type: TC
Location: 113237 - 115009 (-)
Gene ID: HRGMv2_3142_1_105
Type: TC
Location: 115006 - 116451 (-)
Gene ID: HRGMv2_3142_1_106
Type: TF
Location: 116448 - 116894 (-)
Gene ID: HRGMv2_3142_1_107
Type: TF
Location: 116970 - 117866 (-)
Gene ID: HRGMv2_3142_1_108
Type: TC
Location: 117997 - 119352 (+)
Gene ID: HRGMv2_3142_1_109
Type: CAZyme
Location: 119842 - 121656 (-)
Gene ID: HRGMv2_3142_1_110
Type: TC
Location: 121751 - 123838 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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